3、 非同一控制下的企业合并时，购买方在购买日应当以按照《企业会计准则第20号——企业合并》确定的合并成本作为长期股权投资的初始投资成本。按企业合并准则的规定，合并成本主要是指购买方在购买日对作为企业合并对价付出的资产、发生或承担的负债的公允价值。该公允价值与其付出的资产、发生或承担的负债的账面价值的差额，计入当其损益。
例：甲、乙两家公司属非同一控制下的独立公司。甲公司于2006年3月1日以本企业的固定资产对乙企业投资，取得乙公司60%的股份。该固定资产原值1500万元，已提折旧400万元，已提减值准备50万元，在投资当日该设备的公允价值为1250万元。已公司2006年3月1日所有者权益为2000万元。
则该投资的初始投资成本为该固定资产的公允价值1250万元，该成本与固定资产的账面价值1050万元(1500万元-50万元-400万元)的差额200万元应作为营业外收入，会计处理为：
借：长期股权投资 12500000
累计折旧 4000000
固定资产减值准备 500000
贷：固定资产 15000000
营业外收入 2000000
(二)对其他方式获得的长期股权投资初始成本的确认引入了公允价值概念，这与旧会计准则明显不同。体现在以下几个方面：
1、以发行权益性证券取得的长期股权投资，应当按照发行权益性证券的公允价值作为初始投资成本。
2、投资者投入的长期股权投资，应当按照投资合同或协议约定的价值，作为初始投资成本；若合同或协议约定价值不公允，则应使用公允价值。
3、通过非货币性资产:)和通过债务重组取得的长期股权投资，按《非货币性资产:)》、《债务重组》会计准则的规定处理，即：其初始投资成本的确认均使用公允价值。
二、成本法与权益法的适用范围以及两者间的转换
(一)成本法和权益法的适用范围界定
原准则规定对所有控制权的投资(即对子公司的投资)采用权益法核算。新准则规定，长期股权投资的成本法适用于两种情况：①投资企业能够对被投资单位实施控制的长期股权投资；②对被投资单位不具有共同控制或重大影响，并且在活跃的市场中没有报价、公允价值不能可靠计量的长期股权投资。新准则明确规定：对被投资单位具有共同控制或重大影响的长期股权投资，采用权益法来核算。
可见，新准则将投资企业能够对被投资单位实施控制的情况由原来采用权益法核算改为采用成本法来核算，但编制合并报表时应按照权益法进行调整。在权益法下，若初始投资成本大于应享有被投资单位可辨认净资产公允价值份额，该差额不调整初始投资成本；若相反，则该差额需调整股权投资成本，并计入当期损益。
新准则要求在确定能否对被投资单位实施控制或施加重大影响时，应当考虑投资企业和其他方持有的被投资单位当期可转换公司债券、当期可执行的认股权证潜在的表决权因素，更加关注投资企业对被投资企业实际控制能力的大小，而不仅以投资份额的一定比例(20%或50%)作为划分标准。可以说，长期股权投资成本法、权益法及其适用范围是该准则最主要的变化。
(二)成本法与权益法的相关会计处理
1、成本法：新准则对旧准则的规定予以沿用。长期股权投资应当按照初始投资成本计价。追加或收回投资应当调整长期股权投资的成本。被投资单位宣告分派的现金股利或利润，确认为当期投资收益。投资企业确认投资收益，仅限于被投资单位接受投资后产生的累积净利润的分配额；所获得的利润或现金股利超过上述数额的部分，即清算股利，作为初始投资成本的收回。 另外，原准则规定，初始投资时，按照初始投资时的实际成本作为长期股权投资的账面价值。新准则规定，在对非同一控制下取得的子公司采用成本法核算时，按规定确定初始成本后，投资方对初始投资成本大于合并中取得的被购买方可辨认净资产公允价值份额的差额，确认为商誉，投资方对初始投资成本小于合并中取得的被购买方可辨认净资产公允价值份额的差额，应当计入当其损益。
例：丙公司以一台设备换取丁公司60%的股份(丙和丁为非同一控制)，换出设备账面价值为300万元，公允价值250万元。假设合并中取得的被购买方可辨认净资产公允价值为400万元。则：按原准则做法，丙公司对丁公司的初始投资成本为300万元；按新准则规定，丙公司对丁公司的初始投资成本为250万元，换出资产公允价值250万元与其账面价值300万元之间的差额50万元，计入当期损益，反映在营业外支出中。同时，投资方对初始投资成本250万元大于可辨认净资产公允价值份额240万元的差额10万元，确认为商誉。调整后的新的投资成本为240万元。
2、权益法：新准则较之旧准则有较大的变化，体现在：
(1)引入可辨认净资产公允价值的概念。旧准则中长期股权投资的初始投资成本与应享有被投资单位所有者权益的份额进行比较来判断是否该计入当期损益、调整成本等，而在新准则中则是与应享有被投资单位可辨认净资产公允价值的份额相比较。
例1：甲公司于2000年3月1日通过发行普通股股票800万股与乙公司股东进行:)并取得乙公司有表决权的股份20%，对乙公司具有重大影响。甲公司准备长期持有该股份。该股面值为每股1元，市场价格为每股3元，甲公司支付相关费用20万，同日，乙公司可辨认的净资产公允价值为9150万元。
该股票的公允价值为2400万元，加上相关费用，获取投资的总成本为2420万元。而乙公司20%的净资产的公允价值为9150×20%=1830万元，其差额590万元，应确认为商誉。会计处理如下：
借：长期股权投资—乙公司(投资成本) 1830
商誉 590
贷：股本 800
资本公积 1600
银行存款 20
例2：假设所发行的股票的市场价格为每股2元，其他资料与上例一样。
该股票的公允价值为1600万元，再加上相关费用20万元，获得投资的总成本为1620万元，比所获份额公允价值1830万元低210万元，该差额应直接计入当期投资收益。会计处理如下：